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广东省深圳生态环境监测中心站（原深圳市环境监测中心站）成立于1982年，2020年12月因监测垂改更名为广东省深圳生态环境监测中心站，隶属于深圳市生态环境局管理。主要职责是承担全市环境质量监测、海洋监测、生态质量监测、核与辐射监测、污染源监测、较大及以上突发环境事件应急监测、东江流域水环境质量监测等，具备开展空气和废气、水和废气、海水、噪声、振动、辐射、土壤、底质和海洋沉积物、固体废物、生物及生物体残留等14大类环境要素252项1629个参数的监测能力。每年提供实验监测数据约25万个，自动监测数据约480万个。现有职工168名，其中博士学历9人，硕士学历45人，高级以上职称50人。
经过40年的建设和发展，广东省深圳生态环境监测中心站已成为全国环境监测能力***的机构之一。实验基地大楼建筑面积1万㎡，另外有5个野外监测基地和近300个自动监测站点，固定资产投资超6亿元。是全国环境监测系统***“国家认可实验室”，曾获评“全国环境监测系统国家优质实验室”、“全国环保系统先进监测站”、“九五”期间“全国环保系统先进监测站”。系列科技成果获省部级科技进步奖一等奖、广东省环保科技一等奖等奖励。广东省深圳生态环境监测中心站承担多项国家重点研发计划、环保公益科研专项、国家自然科学基金、生态环境部项目等高水平科研项目。2021年获批***科研创新平台“广东大湾区区域生态环境变化与综合治理野外科学观测研究站”，是生态环保系统及深圳市***的国家野外科学观测站。2021年率先在国内开展大气温室气体、海洋碳汇监测“双试点”的碳监测评估试点工作。
广东省深圳生态环境监测中心站将立足“十四五”减污降碳协同增效新形势新任务，加快构建“一核（环境质量监测）两翼（碳监测和生物多样性监测）三支撑（高水平人才队伍和设施、高新领域和新型污染物监测、高效率数据分析和信息化）”的现代化生态环境监测体系，服务深入打好污染防治攻坚战，为应对气候变化、生物多样性保护探路。