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中国农业科学院上海兽医研究所位于上海市闵行区紫竹科学园区，研究所成立于1964年，前身为中国农业科学院家畜血吸虫病研究室和家畜寄生虫病研究所。现有在职职工158名，其中高级职称人员64名，科研人员中入选院级以上人才计划75人次。依托于研究所有国家动物血吸虫病参考实验室、农业农村部动物寄生虫学重点实验室、农业农村部兽用化学药物及制剂学重点实验室、农业农村部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室（上海）、国家家禽工程技术研究中心（上海），研究所也是中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会和农业部血防专家咨询委员会的***单位。研究所重点围绕畜禽重要***和人畜共患动物疫病的基础和防控技术问题开展科学研究。
研究所地处上海紫竹国家高新技术园区内，所区占地60亩，实验办公楼总建筑面积14000多平方米。仪器设备先进，配备齐全，原值达到8000多万元。另建有近2500平方米的学生公寓。