生物信息主管
主健医学股份有限公司
- 公司规模:150-500人
- 公司性质:民营公司
- 公司行业:医疗/护理/卫生
职位信息
- 发布日期:2017-03-08
- 工作地点:上海-杨浦区
- 招聘人数:2人
- 工作经验:2年经验
- 学历要求:硕士
- 语言要求:英语
- 职位月薪:1-1.5万/月
- 职位类别:生物工程/生物制药 医药技术研发管理人员
职位描述
职位描述:
岗位职责:
1. 负责研发组的日常研发数据的质控、分析与解读,建立标准化、流程化的生物统计分析方法并不断维护、更新,设计自动化分析报告;
2. 负责开发适用于高通量测序临床应用产品的新型算法,把握国内外先进基因检测技术及生物信息学分析的发展动态并能够转化到工作之中;
3. 作为研发团队的一员将负责评估社区生物信息学工具,测评和改进现有的生物信息数据分析流程,形成测评报告,提出改进方案,提高分析流程的适用性、效率和准确度;
4. 负责产品规划及产品发展方向的整体把握和工作部署,带领团队完成多种产品的整体规划、设计和完善。根据市场需求,不断优化现有产品、控制成本、开发新产品,从而保证产品线的持续竞争力;
5. 负责在研项目进度管理,研发资料的编写,定期总结项目完成情况,提交项目进展报告。设计科研项目、遗传相关注册项目的试验方案和数据分析方案,制定数据采集标准,协助科研项目基金申报工作;
6. 负责在研项目与其它部门(临床检测、质量等)和外协方(合作医院/高校)的交流与跟进,协调解决合作项目中出现的技术难题,参与撰写科研论文;
7. 负责生物信息分析技术体系的建设,对相关研发及生产人员进行培训,确保研发及生产顺利进行。负责对直接下属的绩效进行考核及有效激励,营造正向的团队合作氛围。同时完成上级领导交办的其他工作;
8. 负责公司数据库的设计,搭建以及日常优化与维护。
岗位要求:
1. 硕士及以上学历,生物信息学、计算生物学、生物统计学、医学信息学、计算机科学等相关专业,已取得以下专业博士学位或具有相关经验的申请者优先:数量遗传学、图形网络理论、NGS、microarray、蛋白质组学数据分析、生物网络分析、数值分析、模拟、控制信息理论、机器学习与模式识别、深度学习、R 语言编程。985/211高校毕业生优先,有海外留学背景者优先,至少有3-5年生物信息分析经验;
2. 拥有良好的计算机编程能力,或优秀的数学/生物学基础,至少精通python,R,shell,matlab,perl,C++,Ruby或Java中一种以上汇编语言。熟悉常用的生物学数据库(NCBI、UCSC、TCGA等)、基础数理统计知识、数据挖掘算法、遗传算法和MYSQL数据库等。熟悉服务器集群、高通量并行运算环境以及数据处理工作流程,有GPU/FPGA等编程开发经验优先;
3. 深入理解基因芯片和二代测序等高通量技术的原理,熟悉二代测序(NGS)的工作流程,包括各种文库的建立、测序平台的操作和生物信息软件的应用。熟练使用二代测序相关的基因组分析软件及流程,熟悉序列拼接、功能注释相关软件。具有1年以上高通量测序下机工作经验,熟悉Illumina、PGM测序平台及Affymetrix芯片并且有算法设计和软件开发经验者优先;
4. 具有较强的项目规划能力,了解基因检测相关的国家政策法规和行业的现状和发展。有在第三方检测机构、诊断公司、基因测序公司类似岗位的从业经验。有海外客户沟通、国际会议发言、国际项目管理经验者优先;有独立撰写自动化流程的经验,有算法开发经历或者担任过大项目负责人经历优先;
5. 具有优秀的团队搭建、团队管理能力,能够带领研发团队实现项目需求。对主管项目有很强的驱动力和资源调配能力,有良好的领导能力、沟通能力、抗压能力、自我驱动能力、文字语言表达能力,较好的逻辑分析能力,具备敏锐的商业嗅觉,对数字敏感;
6. 具有很强的学习能力,能根据文献和客户需求完成各种个性化分析,能熟练查阅各类英文文献,有较强的英语听说读写能力。国际学术刊物上发表过相关论文者优先考虑;
7. 能够批判性地思考技术和过程,开发可扩展性的方法来评估质量。能够分析检测报告中发现的缺陷并且评估风险,作为产品的内部评测,能够评估、权衡和升级。能够与临床、生物技术人员以及数据分析人员合作确定生物信息分析过程、工具及模型的质量,来发展、传递和维护公司的已知知识库。有产品开发经验者优先考虑;
8. 具有遗传咨询师培训经历,或者精准医疗、基因测序产品相关研究经验优先。医学背景者有肿瘤、遗传方向经验优先,农林背景者有GWAS和群体进化经验优先。有三年以上企业研发管理经验,有海外培训和工作经历者优先;
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备注:
目前,我们希望构建一个敏捷型的生物信息团队,成员可以来自包括生物、化学、数学、计算机、医学工程以及临床研究各个领域。同时,研究团队希望保持一种创新、承担风险、数据与科研共享的氛围。我们的主要目标是:提高对妇幼保健领域内疾病的认识与治疗,深度合作,鼓励科研,建立伙伴关系,数据与知识共享,多元化发展。发现隐藏在基因组和其他生物医学数据下的复杂性,通过理解生物学机制开发一些去风险性的新的治疗方法用于治疗围孕期***及幼儿的各种疑难杂症。
主要产品方向如下:
1. 负责基于高通量测序技术(NGS)以及相关辅助技术(定量PCR,Sanger测序,数字PCR)的生物信息分析流程建立与软件开发,开发Illumina/life平台测序数据变异检测算法的实现、优化、代码实现。NGS数据分析,包括测序质量控制,生物信息分析管线质量控制,基因组测序分析(SNP、InDel分析,CNV分析,SV分析,从头组装),外显子捕获测序分析(SNP、InDel鉴定及注释、Somatic SNV/InDel 鉴定及注释、CNV/SV分析鉴定),全基因组(WGS),基因panel,RNA-seq等;
2. 负责Affymetrix的基因芯片及其相关技术的生物信息分析流程的建立与软件开发;
3. 负责宏基因组(含16S)测序领域最新科研动态、技术发展趋势;
4. 从事前沿的人工智能与机器学习(深度神经网络、贝叶斯统计与网络、决策树、随机森林等)在生物信息与医疗应用方面的研究与开发,协助建立强大的数据统计模型和深度学习算法,设计与开发用于大规模生物信息分析,解读,模式识别的基于机器学习的智能系统;
5. 设计易感基因筛查类产品的研发项目方案,产品新算法设计、代码实现,测试等,流程优化升级,撰写文献、专利、课题报告,撰写新的流程文档等。
6. 负责肿瘤ctDNA(循环肿瘤DNA)、循环肿瘤细胞(CTC)测序流程、肿瘤标志物相关的生物信息研发工作,包括相关基因突变流程开发,突变的查找,分析和注释;
7. 负责进行基于大数据和大健康概念的数据管理、存储、解读和算法开发,定期对数据库进行维护和备份;
8. 负责基于数据挖掘和文本挖掘的临床数据挖掘,结合公司的临床数据构建完整的数据注释系统和精准的个性化医疗信息。
9. 负责蛋白质组学研发及技术服务项目的数据处理和高级生物信息学分析;
10. 负责医疗影像(CT、MRI为主)核心算法的研究、设计、开发及单元测试;
11. 根据客户需求,对常见遗传病、罕见病、肿瘤、心血管等疾病为客户提供遗传咨询方案;
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岗位职责:
1. 负责研发组的日常研发数据的质控、分析与解读,建立标准化、流程化的生物统计分析方法并不断维护、更新,设计自动化分析报告;
2. 负责开发适用于高通量测序临床应用产品的新型算法,把握国内外先进基因检测技术及生物信息学分析的发展动态并能够转化到工作之中;
3. 作为研发团队的一员将负责评估社区生物信息学工具,测评和改进现有的生物信息数据分析流程,形成测评报告,提出改进方案,提高分析流程的适用性、效率和准确度;
4. 负责产品规划及产品发展方向的整体把握和工作部署,带领团队完成多种产品的整体规划、设计和完善。根据市场需求,不断优化现有产品、控制成本、开发新产品,从而保证产品线的持续竞争力;
5. 负责在研项目进度管理,研发资料的编写,定期总结项目完成情况,提交项目进展报告。设计科研项目、遗传相关注册项目的试验方案和数据分析方案,制定数据采集标准,协助科研项目基金申报工作;
6. 负责在研项目与其它部门(临床检测、质量等)和外协方(合作医院/高校)的交流与跟进,协调解决合作项目中出现的技术难题,参与撰写科研论文;
7. 负责生物信息分析技术体系的建设,对相关研发及生产人员进行培训,确保研发及生产顺利进行。负责对直接下属的绩效进行考核及有效激励,营造正向的团队合作氛围。同时完成上级领导交办的其他工作;
8. 负责公司数据库的设计,搭建以及日常优化与维护。
岗位要求:
1. 硕士及以上学历,生物信息学、计算生物学、生物统计学、医学信息学、计算机科学等相关专业,已取得以下专业博士学位或具有相关经验的申请者优先:数量遗传学、图形网络理论、NGS、microarray、蛋白质组学数据分析、生物网络分析、数值分析、模拟、控制信息理论、机器学习与模式识别、深度学习、R 语言编程。985/211高校毕业生优先,有海外留学背景者优先,至少有3-5年生物信息分析经验;
2. 拥有良好的计算机编程能力,或优秀的数学/生物学基础,至少精通python,R,shell,matlab,perl,C++,Ruby或Java中一种以上汇编语言。熟悉常用的生物学数据库(NCBI、UCSC、TCGA等)、基础数理统计知识、数据挖掘算法、遗传算法和MYSQL数据库等。熟悉服务器集群、高通量并行运算环境以及数据处理工作流程,有GPU/FPGA等编程开发经验优先;
3. 深入理解基因芯片和二代测序等高通量技术的原理,熟悉二代测序(NGS)的工作流程,包括各种文库的建立、测序平台的操作和生物信息软件的应用。熟练使用二代测序相关的基因组分析软件及流程,熟悉序列拼接、功能注释相关软件。具有1年以上高通量测序下机工作经验,熟悉Illumina、PGM测序平台及Affymetrix芯片并且有算法设计和软件开发经验者优先;
4. 具有较强的项目规划能力,了解基因检测相关的国家政策法规和行业的现状和发展。有在第三方检测机构、诊断公司、基因测序公司类似岗位的从业经验。有海外客户沟通、国际会议发言、国际项目管理经验者优先;有独立撰写自动化流程的经验,有算法开发经历或者担任过大项目负责人经历优先;
5. 具有优秀的团队搭建、团队管理能力,能够带领研发团队实现项目需求。对主管项目有很强的驱动力和资源调配能力,有良好的领导能力、沟通能力、抗压能力、自我驱动能力、文字语言表达能力,较好的逻辑分析能力,具备敏锐的商业嗅觉,对数字敏感;
6. 具有很强的学习能力,能根据文献和客户需求完成各种个性化分析,能熟练查阅各类英文文献,有较强的英语听说读写能力。国际学术刊物上发表过相关论文者优先考虑;
7. 能够批判性地思考技术和过程,开发可扩展性的方法来评估质量。能够分析检测报告中发现的缺陷并且评估风险,作为产品的内部评测,能够评估、权衡和升级。能够与临床、生物技术人员以及数据分析人员合作确定生物信息分析过程、工具及模型的质量,来发展、传递和维护公司的已知知识库。有产品开发经验者优先考虑;
8. 具有遗传咨询师培训经历,或者精准医疗、基因测序产品相关研究经验优先。医学背景者有肿瘤、遗传方向经验优先,农林背景者有GWAS和群体进化经验优先。有三年以上企业研发管理经验,有海外培训和工作经历者优先;
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备注:
目前,我们希望构建一个敏捷型的生物信息团队,成员可以来自包括生物、化学、数学、计算机、医学工程以及临床研究各个领域。同时,研究团队希望保持一种创新、承担风险、数据与科研共享的氛围。我们的主要目标是:提高对妇幼保健领域内疾病的认识与治疗,深度合作,鼓励科研,建立伙伴关系,数据与知识共享,多元化发展。发现隐藏在基因组和其他生物医学数据下的复杂性,通过理解生物学机制开发一些去风险性的新的治疗方法用于治疗围孕期***及幼儿的各种疑难杂症。
主要产品方向如下:
1. 负责基于高通量测序技术(NGS)以及相关辅助技术(定量PCR,Sanger测序,数字PCR)的生物信息分析流程建立与软件开发,开发Illumina/life平台测序数据变异检测算法的实现、优化、代码实现。NGS数据分析,包括测序质量控制,生物信息分析管线质量控制,基因组测序分析(SNP、InDel分析,CNV分析,SV分析,从头组装),外显子捕获测序分析(SNP、InDel鉴定及注释、Somatic SNV/InDel 鉴定及注释、CNV/SV分析鉴定),全基因组(WGS),基因panel,RNA-seq等;
2. 负责Affymetrix的基因芯片及其相关技术的生物信息分析流程的建立与软件开发;
3. 负责宏基因组(含16S)测序领域最新科研动态、技术发展趋势;
4. 从事前沿的人工智能与机器学习(深度神经网络、贝叶斯统计与网络、决策树、随机森林等)在生物信息与医疗应用方面的研究与开发,协助建立强大的数据统计模型和深度学习算法,设计与开发用于大规模生物信息分析,解读,模式识别的基于机器学习的智能系统;
5. 设计易感基因筛查类产品的研发项目方案,产品新算法设计、代码实现,测试等,流程优化升级,撰写文献、专利、课题报告,撰写新的流程文档等。
6. 负责肿瘤ctDNA(循环肿瘤DNA)、循环肿瘤细胞(CTC)测序流程、肿瘤标志物相关的生物信息研发工作,包括相关基因突变流程开发,突变的查找,分析和注释;
7. 负责进行基于大数据和大健康概念的数据管理、存储、解读和算法开发,定期对数据库进行维护和备份;
8. 负责基于数据挖掘和文本挖掘的临床数据挖掘,结合公司的临床数据构建完整的数据注释系统和精准的个性化医疗信息。
9. 负责蛋白质组学研发及技术服务项目的数据处理和高级生物信息学分析;
10. 负责医疗影像(CT、MRI为主)核心算法的研究、设计、开发及单元测试;
11. 根据客户需求,对常见遗传病、罕见病、肿瘤、心血管等疾病为客户提供遗传咨询方案;
职能类别: 生物工程/生物制药 医药技术研发管理人员
公司介绍
主健医学股份有限公司是上海股交中心挂牌的企业(股份代码:100052),是我国分子医学技术应用于临床实践的倡导者,市值超过10亿人民币。公司主要从事妇幼保健与出生缺陷干预、个体化诊疗与智能医疗的研究开发、医疗技术服务及临床培训等业务,为覆盖全国29个省份的300多家医疗机构提供医学检验、数据库与数据分析等技术支持,是集成果转化、行业标准制定、国际合作及人才培养于一体的创新型企业。公司拥有《医疗机构执业许可证》和《司法鉴定许可证》,是清科“2013年中国最具投资价值企业”50强企业和上海股交中心“2014年度最受投资者关注转让系统挂牌公司”。
公司由在上海、北京、苏州、海南等地7家子公司,及4所研究院、研究所组成,形成了完整的科研与服务并举的可持续发展商业模式。与国家妇幼保健中心、中国妇幼保健协会、十几所高校紧密合作,依托国家妇幼保健分子遗传医学研究专项计划专家委员会、中国妇幼保健协会细胞分子医学专业委员会、国家妇幼分子遗传医学检验项目专家委员会的专家资源,开展了近10项大型多中心临床科学研究项目;在国家妇幼保健分子遗传医学研究专项计划办公室、国家妇幼分子遗传医学检验项目(GTP)办公室的支持下,通过继续医学教育、专项临床科学研究、专业学术会议等拓展公司的业务发展。
2013年,公司的“妇幼保健出生缺陷干预研究中心”项目正式入驻上海国际医学园区;12月,经上海市科协批准公司院士专家工作站成立; 2015年,公司与中国妇幼保健协会、国家妇幼保健中心上海市妇幼保健中心达成合作,在上海建立“妇幼保健适宜技术应用与科研支持平台”。
目前公司运营模式探索已经完成,内外支撑体系已经建立,线上线下技术支持构建已经完成,全国范围的组织模式已经成功运行;分子诊断行业在中国蓄势待发,相信主健医学的整体布局和创新积累优势必将让我们在这项朝阳产业中茁壮成长,欢迎各方有识之士加入我们,一起开拓探索,为实现主键医学“让家家都有健康的孩子”的理念与目标共同努力。
主健医学提供的不仅仅是一份职业,而是您事业发展的机会!
公司网址:www.zhujianyixue.com
公司由在上海、北京、苏州、海南等地7家子公司,及4所研究院、研究所组成,形成了完整的科研与服务并举的可持续发展商业模式。与国家妇幼保健中心、中国妇幼保健协会、十几所高校紧密合作,依托国家妇幼保健分子遗传医学研究专项计划专家委员会、中国妇幼保健协会细胞分子医学专业委员会、国家妇幼分子遗传医学检验项目专家委员会的专家资源,开展了近10项大型多中心临床科学研究项目;在国家妇幼保健分子遗传医学研究专项计划办公室、国家妇幼分子遗传医学检验项目(GTP)办公室的支持下,通过继续医学教育、专项临床科学研究、专业学术会议等拓展公司的业务发展。
2013年,公司的“妇幼保健出生缺陷干预研究中心”项目正式入驻上海国际医学园区;12月,经上海市科协批准公司院士专家工作站成立; 2015年,公司与中国妇幼保健协会、国家妇幼保健中心上海市妇幼保健中心达成合作,在上海建立“妇幼保健适宜技术应用与科研支持平台”。
目前公司运营模式探索已经完成,内外支撑体系已经建立,线上线下技术支持构建已经完成,全国范围的组织模式已经成功运行;分子诊断行业在中国蓄势待发,相信主健医学的整体布局和创新积累优势必将让我们在这项朝阳产业中茁壮成长,欢迎各方有识之士加入我们,一起开拓探索,为实现主键医学“让家家都有健康的孩子”的理念与目标共同努力。
主健医学提供的不仅仅是一份职业,而是您事业发展的机会!
公司网址:www.zhujianyixue.com
联系方式
- Email:liuxiaowen@genechina.com