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生物信息工程师

主健医学股份有限公司

  • 公司规模:150-500人
  • 公司性质:民营公司
  • 公司行业:医疗/护理/卫生

职位信息

  • 发布日期:2017-03-08
  • 工作地点:上海-杨浦区
  • 招聘人数:3人
  • 学历要求:硕士
  • 语言要求:英语
  • 职位月薪:0.6-1.1万/月
  • 职位类别:生物工程/生物制药  医药技术研发人员

职位描述

职位描述:
岗位职责:
1. 在linux的环境下设计和开发自动处理和分析生物信息数据的pipeline;
2. 根据需求设计和开发相关生物信息软件和web应用;把生物信息数据图形化,完善用户界面;
3. 根据需求设计把生物信息数据储存在数据库里并定时更新维护;
4. 为公司开发的软件和数据分析服务等提供技术支持;
5. 与实验人员进行良好沟通,协助完成数据的分析整理及科研工作;
6. 能够完成上级指派和分析流程中各种日常信息分析工作。


岗位要求:
1. 硕士及以上学历,统计、数学、生物、物理、计算机等相关专业,985/211高校毕业生优先,至少有2-3年生物信息分析经验;

2. 拥有良好的计算机编程能力,或优秀的数学/生物学基础,至少精通python,R,shell,matlab,perl,C++,Ruby或Java中一种以上汇编语言。熟悉常用的生物学数据库(NCBI、UCSC、TCGA等)、基础数理统计知识、数据挖掘算法、遗传算法和MYSQL数据库等。熟悉服务器集群、高通量并行运算环境以及数据处理工作流程,有GPU/FPGA等编程开发经验优先;

3. 深入理解基因芯片和二代测序等高通量技术的原理,熟悉二代测序(NGS)的工作流程,包括各种文库的建立、测序平台的操作和生物信息软件的应用。熟练使用二代测序相关的基因组分析软件及流程,熟悉序列拼接、功能注释相关软件。具有1年以上高通量测序下机工作经验,熟悉Illumina、PGM测序平台及Affymetrix芯片并且有算法设计和软件开发经验者优先;

4. 有创新精神,思维活跃,具备系统严谨的研究思维,具备独立分析及解决问题的能力,能够承担较大工作压力和高强度技术开发日程,对高通量测序领域有浓厚的兴趣;

5. 高度的责任心,认真细致,吃苦耐劳,愿意与公司共同成长;

6. 具备良好的语言表达能力、沟通技巧以及团队协作能力。

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备注:

目前,我们希望构建一个敏捷型的生物信息团队,成员可以来自包括生物、化学、数学、计算机、医学工程以及临床研究各个领域。同时,研究团队希望保持一种创新、承担风险、数据与科研共享的氛围。我们的主要目标是:提高对妇幼保健领域内疾病的认识与治疗,深度合作,鼓励科研,建立伙伴关系,数据与知识共享,多元化发展。发现隐藏在基因组和其他生物医学数据下的复杂性,通过理解生物学机制开发一些去风险性的新的治疗方法用于治疗围孕期***及幼儿的各种疑难杂症。


主要产品方向如下:
1. 负责基于高通量测序技术(NGS)以及相关辅助技术(定量PCR,Sanger测序,数字PCR)的生物信息分析流程建立与软件开发,开发Illumina/life平台测序数据变异检测算法的实现、优化、代码实现。NGS数据分析,包括测序质量控制,生物信息分析管线质量控制,基因组测序分析(SNP、InDel分析,CNV分析,SV分析,从头组装),外显子捕获测序分析(SNP、InDel鉴定及注释、Somatic SNV/InDel 鉴定及注释、CNV/SV分析鉴定),全基因组(WGS),基因panel,RNA-seq等;
2. 负责Affymetrix的基因芯片及其相关技术的生物信息分析流程的建立与软件开发;
3. 负责宏基因组(含16S)测序领域最新科研动态、技术发展趋势;
4. 从事前沿的人工智能与机器学习(深度神经网络、贝叶斯统计与网络、决策树、随机森林等)在生物信息与医疗应用方面的研究与开发,协助建立强大的数据统计模型和深度学习算法,设计与开发用于大规模生物信息分析,解读,模式识别的基于机器学习的智能系统;
5. 设计易感基因筛查类产品的研发项目方案,产品新算法设计、代码实现,测试等,流程优化升级,撰写文献、专利、课题报告,撰写新的流程文档等。
6. 负责肿瘤ctDNA(循环肿瘤DNA)、循环肿瘤细胞(CTC)测序流程、肿瘤标志物相关的生物信息研发工作,包括相关基因突变流程开发,突变的查找,分析和注释;
7. 负责进行基于大数据和大健康概念的数据管理、存储、解读和算法开发,定期对数据库进行维护和备份;
8. 负责基于数据挖掘和文本挖掘的临床数据挖掘,结合公司的临床数据构建完整的数据注释系统和精准的个性化医疗信息。
9. 负责蛋白质组学研发及技术服务项目的数据处理和高级生物信息学分析;
10. 负责医疗影像(CT、MRI为主)核心算法的研究、设计、开发及单元测试;
11. 根据客户需求,对常见遗传病、罕见病、肿瘤、心血管等疾病为客户提供遗传咨询方案;

职能类别: 生物工程/生物制药 医药技术研发人员

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公司介绍

    主健医学股份有限公司是上海股交中心挂牌的企业(股份代码:100052),是我国分子医学技术应用于临床实践的倡导者,市值超过10亿人民币。公司主要从事妇幼保健与出生缺陷干预、个体化诊疗与智能医疗的研究开发、医疗技术服务及临床培训等业务,为覆盖全国29个省份的300多家医疗机构提供医学检验、数据库与数据分析等技术支持,是集成果转化、行业标准制定、国际合作及人才培养于一体的创新型企业。公司拥有《医疗机构执业许可证》和《司法鉴定许可证》,是清科“2013年中国最具投资价值企业”50强企业和上海股交中心“2014年度最受投资者关注转让系统挂牌公司”。
    公司由在上海、北京、苏州、海南等地7家子公司,及4所研究院、研究所组成,形成了完整的科研与服务并举的可持续发展商业模式。与国家妇幼保健中心、中国妇幼保健协会、十几所高校紧密合作,依托国家妇幼保健分子遗传医学研究专项计划专家委员会、中国妇幼保健协会细胞分子医学专业委员会、国家妇幼分子遗传医学检验项目专家委员会的专家资源,开展了近10项大型多中心临床科学研究项目;在国家妇幼保健分子遗传医学研究专项计划办公室、国家妇幼分子遗传医学检验项目(GTP)办公室的支持下,通过继续医学教育、专项临床科学研究、专业学术会议等拓展公司的业务发展。
    2013年,公司的“妇幼保健出生缺陷干预研究中心”项目正式入驻上海国际医学园区;12月,经上海市科协批准公司院士专家工作站成立; 2015年,公司与中国妇幼保健协会、国家妇幼保健中心上海市妇幼保健中心达成合作,在上海建立“妇幼保健适宜技术应用与科研支持平台”。
    目前公司运营模式探索已经完成,内外支撑体系已经建立,线上线下技术支持构建已经完成,全国范围的组织模式已经成功运行;分子诊断行业在中国蓄势待发,相信主健医学的整体布局和创新积累优势必将让我们在这项朝阳产业中茁壮成长,欢迎各方有识之士加入我们,一起开拓探索,为实现主键医学“让家家都有健康的孩子”的理念与目标共同努力。
    主健医学提供的不仅仅是一份职业,而是您事业发展的机会!
    公司网址:www.zhujianyixue.com

联系方式

  • Email:liuxiaowen@genechina.com