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重庆高新区飞马创新研究院（以下简称“研究院”）是在中国兵器工业集团有限公司和重庆市人民政府战略合作框架下，由中国兵器科学研究院、重庆市九龙坡区人民政府、重庆理工大学三方于2018年11月共建的备案制事业单位。研究院以“引领科技创新、培养高端人才、强化成果转化、服务地方经济”为宗旨，是军、民、政、融、产、学、研多位一体的体制机制创新平台，是集多方参与的军民两用技术研发、军民两用高端人才集聚和培养、科技成果转化、机制体制创新示范于一体的新型高端平台。
目前，研究院共有员工107人（含***人员），其中，院士1人、正高职称专家17人、副高职称专家4人、博士9人、硕士47人，具有国防重点项目总师经历专家6人、享受国务院政府特殊津贴专家5人。并已成功入驻科研项目团队10个、意向入驻科研项目团队10余个，团队成员累计获得国家科技进步奖10余项、省部级以上奖项100余项，汇聚了一批国内重点院校、科研机构、优质企业等单位相关技术领域的知名专家，初步形成了跨地域、跨学科、跨行业的创新团队。
研究院立足重庆、辐射全国，主要聚焦“装备体系研究、体系仿真技术、先进机动平台、北斗技术应用、新材料应用、光电与信息技术、智能通信技术、可靠性工程与检测技术、人工智能应用、数字化试验与训练”等十个领域，下设装备体系研究所、体系仿真研究所、智能装备技术研究所、无人平台技术研究所、北高遥应用技术研究所、新材料与先进制造研究所、光电信息技术研究所、生物工程技术研究所、智能通信技术研究所、数字化试验与训练研究所等十个研究所。成立以来，研究院签订科研合同17项，合同金额共计1.15亿元。
同时，为加快科研项目产业化运作，研究院构建了军民两用成果转化体系，创建了成果转化高效运行机制，制定了《促进成果转化管理办法》，以知识产权、智力作价入股、引进创新资本、品牌渠道聚合效应等方式作为主要手段，加速项目成果落地转化。截止目前，产业转化项目库共计入库17个项目，其中1个项目已完成公司注册，7个项目产业化方案已基本确定。此外，研究院围绕重庆重点产业的技术需求，引进兵科院优势技术和其他先进成果落地重庆，形成一批高新技术产品和产业。
未来，重庆高新区飞马创新研究院将建成国内领先、国际一流的先进技术研发和成果转化基地，形成批量可产业化的科技成果和高新技术产品，构建转移转化通道，形成规模化应用，预计产业规模超过百亿，孵化科技型企业50家，上市公司5家以上。将打造成为高级技术创新研发基地、高端人才聚集基地、科技成果孵化转移基地、机制体制创新示范基地。结合现有优势，多域联动、穿透行业壁垒，以飞马研究院为核心，依托国防科技创新快速响应小组（重庆）、国家国防科工局智能兵器创新中心、B8协同创新联盟等平台，逐步形成科技创新及产业化生态圈。
重庆高新区飞马创新研究院脚踏实地、着眼未来，开放合作、创新发展，落实国家战略、服务地方经济、实现各方共赢，努力成为新领域的开拓者、新经济的排头兵、新平台的架构师。