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北京清能创新科技有限公司原名北京清华同方科技公司，组建于1992年5月，是一家以清华大学的高科技为依托并经北京市科学技术委员会认定的高新技术企业。2005年公司通过股份制改革，由清华控股有限公司和中核能源科技有限公司合作投资组建，注册资本1552.49万元，改名为北京清能创新科技有限公司。2012年1月，清华控股有限公司通过《股权转让合同》回购了中核能源科技有限公司持有的5.50%股权，公司变为清华控股有限公司的全资子公司。
 北京清能创新科技有限公司下设部门：核孔膜事业部、核电事业部、能源环境事业部、水务工程事业部
公司与“清华大学核能与新能源技术研究院”（简称“核研院”）有紧密的合作关系。二十多年来，核研院一直是公司持续发展的坚强后盾；公司也成为核研院高科技成果的孵化器，对外产业化合作的纽带和产品的销售窗口。
 
公司在经过股份制改革以后，逐步进入了规范管理的经营模式。近两年公司投入较多人力和财力积极开展有自主知识产权的研发项目。国产第一台口罩检测台已试制成功，填补了我国在口罩检测行业国产产品的空白；用于环保领域的反应器式BOD快速测定仪已完成样机的开发工作。
在核技术应用产业中，公司致力于冷轧板材测厚仪的生产和销售，先后推出QNT-2、QNT-3、QNT-4等系列产品，行销国内外，总销售量已超过5000台。
公司的汽车胶管生产线工艺和成套装备已达到世界先进水平。不但向国内汽车工业提供汽车胶管生产线工艺和装备，先后建设了200多条汽车胶管生产线，而且已向日本、印度尼西亚等国家出口成套装备，并建立了国外销售代理。
       核径迹防伪膜和防伪标识是公司的特色产品，由于生产过程利用了核反应堆辐照技术，因此该产品具有唯一性、难以仿造、检验方便等特点。核径迹防伪技术已在图书发行、药品、名酒等行业逐步推广，取得了很好的效果。
 公司以“创新求实、和谐奋进”为企业理念积极投身于能源环保行业，力争为社会发展做出更大贡献。